Eesti Põllumajandusmuuseumi tööd juhib Eesti Põllumajandusmuuseumi direktori käskkirjaga käskkirjaga nr1-9/6, 30. mail 2011. aastal kinnitatud teadusnõukogu koosseisus:
- PhD Mare Kõiva – teadusnõukogu esimees, Eesti Kirjandusmuuseumi folkloristika osakonna juhataja;
- PhD Aleksei Peterson – teadusnõukogu aseesimees, pensionär;
- Aivar Aleksejev – Ülenurme vallavanem;
- Natali Happonen – Tartu Kutsehariduskeskuse info- ja karjäärinõustamiskeskuse projektijuht;
- Kaire Ilula (asendab Anne Grišan) – Eesti Põllumajandusmuuseumi peavarahoidja- osakonnajuhataja;
- Monika Jõemaa – C. R. Jakobsoni Talumuuseumi direktor;
- DSc Juhan Jõudu – Eesti Maaülikooli emeriitprofessor;
- Liina Kaljula – Eesti Vabariigi Põllumajandusministeeriumi teadus- ja arendusosakonna peaspetsialist;
- DSc Lembit Lepasalu – Eesti Maaülikooli lektor;
- Sirje Pärismaa – Eesti Maaülikooli avalikkussuhete peaspetsialist;
- Reet Roop – Põlva Talurahvamuuseumi direktor;
- knd Tiit Rosenberg – Tartu Ülikooli Eesti ajaloo professor;
- DSc Olev Saveli – Eesti Maaülikooli emeriitprofessor;
- MA Merli Sild – Eesti Põllumajandusmuuseumi direktor;
- Eda Tagamets – Tartu Maavalitsuse avalike suhete peaspetsialist;
- MA Ilme Tupits – Jõgeva Sordiaretuse Instituudi teadur;
- MA Ell Vahtramäe – Eesti Põllumajandusmuuseumi teadussekretär;
- Mare Viiralt – Eesti põllumajandusmuuseumi näituste ja muuseumipedagoogika osakonna juhataja;
- MA Aret Vooremäe – Eesti Maaülikooli põllumajandus- ja keskkonnainstituudi direktor;
- Ants Välimäe – Eesti Piimandusmuuseumi direktor.
Põhimäärus
Üldsätted
Eesti Põllumajandusmuuseumi (Põllumajandusmuuseumi) teadusnõukogu on Eesti Põllumajandusmuuseumi teadus- ja arendustegevusega seotud küsimuste otsustamiseks Eesti Põllumajandusmuuseumi direktori käskkirjaga moodustatud nõuandev kogu asukohaga Pargi 4, Ülenurme, Tartu maakond. Nõukogu kasutab Põllumajandusmuuseumi kirjaplanki.
Põhiülesanded
- Teeb põllumajandusministrile ettepanekuid Põllumajandusmuuseumi põhimääruse muutmiseks.
- Aitab kaasa Põllumajandusmuuseumi teadus- ja arendustööle ning asutuse üldisele arengule
- Kinnitab teadusteemad, projektid, grandid ja nende täitmise aruanded.
- Kinnitab Eesti Teadusfondi ja riiklike programmide grantide lõpparuanded.
- Kinnitab õigusaktides sätestatud korras Põllumajandusmuuseumi korralised teadustöötajad, on esindatud konkursikomisjonis.
- Kuulab ära Põllumajandusmuuseumi eelmise aasta tegevusaruande.
- Esitab Põllumajandusmuuseumi töötajaid majavälisteks autasustamisteks, auliikmeteks valimiseks ning annab vastavaid soovitusi.
Koosseis
- Nõukogu on kuni 25-liikmeline. Liikmete hulgast valitakse nõukogu esimees, kes nimetab kandidaadi aseesimehe kohale.
- Põllumajandusmuuseumi esindavad nõukogus teaduse ja kogude osakonna ning näituste ja muuseumipedagoogika osakonna juhatajad. Nõukokku kuulub teadussekretär. Põllumajandusmuuseumi teadusnõukogusse kuulub vähemalt 9 välisliiget, kes esindavad Põllumajandusmuuseumi profiilile vastava erialaga teadustöötajaid, kutseharidust ja muuseume.
- Nõukogu koosseisu kinnitab Põllumajandusmuuseumi direktor viieks aastaks.
Töökorraldus
- Nõukogu peamiseks töövormiks on koosolek, mille kutsub kokku nõukogu esimees, tema äraolekul aseesimees või 1/3 nõukogu liikmete nõudmisel.
- Nõukogu korraldab koosolekuid vastavalt vajadusele, kuid mitte vähem kui kaks korda aastas.
- Nõukogu on otsustusvõimeline, kui kohal on üle poole nõukogu liikmetest.
- Nõukogu otsused tehakse lihthäälteenamusega. Häälte võrdse jagunemise korral on otsustavaks esimehe, tema äraolekul aseesimehe hääl.
- Nõukogu asjaajamine toimub Põllumajandusmuuseumi kaudu.
- Nõukogu otsused vormistatakse protokollina. Protokollile kirjutab alla esimees.
- Nõukogul on oma meililist. Nõukogu liikmed võivad hääletada e-posti teel.
Lõppsätted
Nõukogu tegevuse lõpetab Põllumajandusmuuseumi direktor, kui see vajadus tuleneb muudatustest Põllumajandusmuuseumi põhimääruses või Teadus- ja arendustegevuse korralduse seaduses.
Põhimäärus kinnitatud Eesti Põllumajandusmuuseumi direktori käskkirjaga 23. maist 2006. aastal nr 1-9/33.